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堿基順序比對(duì)工具 - Sequence Manipulation Suite

堿基順序比對(duì)工具（按堿基標(biāo)顏色）可以將FASTA格式或者GDE格式的多條序列，逐個(gè)堿基進(jìn)行比對(duì)，根據(jù)比對(duì)情況標(biāo)記相應(yīng)的顏色。與Blast不同，它不會(huì)考慮gap，它只是簡(jiǎn)單按照堿基順序逐一進(jìn)行比較。特定堿基位如果完全相同則標(biāo)記為黑色，如果不完全相同則標(biāo)記為灰色，如果完全不同則留為白色。您可以控制堿基相似率，大于這個(gè)相似率即可顯示為黑色背景。

輸入多條FASTA格式或GDE格式的序列，長(zhǎng)度限定在200000個(gè)字符.

>CremaneiFEM-2
-------------------MSDSLNHPSSSTVHADDGFEPPTSPEDNNKK
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YNDLAHYICHEAIAHGSTDNVTVVIGFLRPPQDLWRMMKIDEESDEEEDE
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每行顯示個(gè)堿基.
堿基相同率達(dá)到多少，可認(rèn)為是序列一致:
*顏色標(biāo)記方法 .

輸入一組相似氨基酸并用逗號(hào)隔開(kāi)，它將被用于相似程度計(jì)算。如果您是要比對(duì)DNA序列，請(qǐng)留空。

輸入每條序列比對(duì)時(shí)的開(kāi)始位置，并用逗號(hào)隔開(kāi)，順序請(qǐng)保持與序列順序一致. 形式如: 0, 200, 0, -1. 如果沒(méi)有指定，則默認(rèn)為從第一位置（0位）開(kāi)始。

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