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限制性酶切位點分布圖
限制性酶切位點分布圖以格式化文字的形式將限制性酶切位點標記在序列中。輸出結(jié)果還會根據(jù)閱讀框的位置,列出翻譯后的蛋白序列。當計劃克隆策略的時候,可以參考此工具。本工具支持IUPAC字符和多種密碼子。
輸入原始序列或1至多條FASTA格式序列,長度限定在100000以內(nèi)。
>sample sequence cagctggggggaggtggcgaggaagatgacgtggtagttgtcgcggcagctgccaggagaagtagcaagaaaaataacatgataattatcacgacaactacctggtgatgttgctagtaatattacttgttatttttctcgtcatcttcccggcgacgtcgccagcaacatcacctgctacttctcccgccacctccc
* 每行顯示
105
90
75
60
45
30
個堿基.
* 顯示翻譯結(jié)果,閱讀框位于
1
2
3
1, 2, and 3
大寫字符
none
* 使用
standard (1)
vertebrate mitochondrial (2)
yeast mitochondrial (3)
mold mitochondrial (4)
invertebrate mitochondrial (5)
ciliate nuclear (6)
echinoderm mitochondrial (9)
euplotid nuclear (10)
bacterial (11)
alternative yeast nuclear (12)
ascidian mitochondrial (13)
flatworm mitochondrial (14)
Blepharisma macronuclear (15)
chlorophycean mitochondrial (16)
trematode mitochondrial (21)
Scenedesmus obliquus mitochondrial (22)
Thraustochytrium mitochondrial (23)
密碼子
.
* 目標序列為
線性
環(huán)形
分子.
* 以
彩色
黑白
輸出.
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